Prof. Dr. Manuel Liebeke

Vollmitglied

Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
Institut für Humanernährung und Lebensmittelkunde
Abteilung Metabolomics

mliebeke@metabolomics.uni-kiel.de

Heinrich Hecht Platz 10

24118 Kiel

Informationen über Prof. Dr. Manuel Liebeke

Manuel Liebeke ist seit April 2023 Professor für Metabolomik am Institut für Humanernährung und Lebensmittelkunde an der Agrar- und Ernährungswissenschaftlichen Fakultät der CAU. Seine Professur ist eine Exzellenz-Professur in den Kieler Lebenswissenschaften als Schnittstelle zwischen lebenswissenschaftlicher und klinischer Forschung.

Sein Forschungsfeld, die räumliche Metabolomik ist hochmodern. Mit ihr ist es möglich, in das Innere der Zellen zu schauen und die komplexen Wechselwirkungen im Stoffwechsel detailgenau zu erforschen. So kann Manuel Liebeke Geheimnisse der zellulären Stoffwechselzustände ergründen, Wirt-Mikroben-Interaktionen auf mikroskopischer Ebene erforschen, metabolische Zellzustände verfolgen und räumliche Abbildungen der metabolischen Aktivität erstellen. Diese Erkenntnisse sind auch für den klinischen Bereich von großer Bedeutung. Sie können zum Beispiel bei der Aufklärung von Krankheitsursachen chronisch-entzündlicher Darmerkrankungen helfen, die auf Störungen des menschlichen Darmmikrobioms beruhen.

„Unsere Forschung fokussiert sich auf die faszinierende Welt chemischer Interaktionen zwischen Organismen. Dabei untersuchen wir insbesondere Lebensgemeinschaften von Tieren und Mikroorganismen. Bei deren Interaktion spielen kleine Moleküle, sogenannte Metabolite, eine zentrale Rolle. Sie entstehen als Zwischenstufen oder Abbauprodukte von Stoffwechselvorgängen der Organismen und bilden das Grundgerüst für die chemische Kommunikation in diesen Partnerschaften. Mit innovativen Techniken wie der massenspektrometrischen Bildgebung und Fluoreszenzmikroskopie versuchen wir die chemische Kommunikation zwischen Bakterienzellen und Wirtszellen zu entschlüsseln und so besser zu verstehen, wie diese Metabolite das Zusammenleben von Tieren und Mikroben beeinflussen und welche Auswirkungen dies auf Ökosysteme und Gesundheit haben könnte.“

Für seine Forschung nutzt Liebeke moderne Massenspektrometrie-Methoden, um zu verstehen, welche Moleküle in Wirt-Mikroben-Systemen beteiligt sind, wie verschiedene Metaboliten ökologische Gemeinschaften formen und wie die Symbiosepartner metabolisch auf Umweltveränderungen reagieren.

Forschungsschwerpunkte:

bildgebende Massenspektrometrie zur Visualisierung von Bakterien und deren Metaboliten
Metabolomik von Umweltproben wie zum Beispiel Seewasser sowie Tier- und Pflanzengewebe.
metabolische Interaktionen innerhalb von Symbiosen, zum Beispiel zwischen Würmern und den bakteriellen Symbionten.

Jahr	Tätigkeit	Ort
2023	Professur für Metabolomik am Institut für Humanernährung und Lebensmittelkunde	Christian-Albrechts-Universität zu Kiel
2012 - 2022	Gast-Professur	DTU Copenhagen
2013 - 2018	Wissenschaftlicher Mitarbeiter	Max Planck Institut für marin Mikrobiologie
2010 - 2013	Wissenschaftlicher Mitarbeiter	Imperial College London
2010	Promotion in pharmazeutischer Biologie zum Thema „Establishment and application of techniques for microbial metabolomics“	Universität Greifswald
2006	Diplomarbeit am Institut für Pharmazie und Approbation als Pharmazeut	Universität Greifswald
2001-2005	Studium der Pharmazie	Universität Greifswald

*Corresponding author is indicated with underlined

Preprints

Saharuka, V., Vieira, L. M., Stuart, L., Ekelöf, M., Molenaar, M. R., Bailoni, A., Ovchinnikova, K., Soltwisch, J., Bausbacher, T., Jakob, D., King, M., Müller, M. A., Oetjen, J., Pace, C., Pinto, F. E., Strittmatter, N., Velickovic, D., Spengler, B., Muddiman, D. C., Liebeke, M., Janfelt, C., Goodwin, R., Eberlin, L. S., Anderton, C. R., Hopf, C., Dreisewerd, K., Alexandrov, T.,Biorxiv doi: https://doi.org/10.1101/2024.01.29.577354, “Large-Scale Evaluation of Spatial Metabolomics Protocols and Technologies“
Kleiner, M., Polerecky, L., Lott, C., Bergin, C., Häusler, S., Liebeke, M., Wentrup, C., Musat, N., Kuypers, M. M. M., Dubilier, N., Biorxiv https://doi.org/10.1101/2023.11.25.568684, „Mechanism of high energy efficiency of carbon fixation by sulfur-oxidizing symbionts revealed by single-cell analyses and metabolic modeling“
Alexandrov, T., Ovchinnikova, K., Palmer, A., Kovalev, V., Tarasov, A., Stuart, L., Nigmetzianov, R., Fay, D., Liebeke, M, …Key METASPACE Contributors, biorxiv doi: https://doi.org/10.1101/539478, “METASPACE: A community-populated knowledge base of spatial metabolomes in health and disease”

peer-reviewed

2024

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Zuffa, S., …, Bourceau, P., Liebeke, M., …Dorrestein, P.
Nature Microbiology , in press and bioRxiv 2023.07.20.549584; doi: https://doi.org/10.1101/2023.07.20.549584, „A Taxonomically-informed Mass Spectrometry Search Tool for Microbial Metabolomics Data“

2023

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2022

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2021

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MALDI-komplett — Bei MALDI-Imaging Massenspektrometrie handelt es sich um eine bildgebende Methode zur Analyse chemischer Verbindungen und deren räumlicher Verteilung in einer Probe. Die Abkürzung MALDI bedeutet übersetzt Matrix-unterstützte Laser-Desorption/Ionisation.

Metabolomik ist eine Schlüsselmethode in den modernen Lebenswissenschaften, um den Einfluss des Mikrobioms auf unsere Biologie zu ergründen. Sie ermöglicht es, chemische Signale zu entschlüsseln, die das Mikrobiom an die Umgebung sendet. Dabei werden molekulare Stoffwechselverbindungen in biologischen Systemen analytisch erfasst. Gemeinsam mit seinem Team arbeitet Manuel Liebeke am Aufbau einer Metabolomik-Plattform, die in der gesamten Kieler Uni genutzt werden kann.

Die Forschung im Labor wird ständig von Methodenentwicklungen wie der hochauflösenden Massenspektrometrie und Fluoreszenzmikroskopie vorangetrieben, um das räumliche Metabolom von mikrobiellen Systemen aufzudecken.

Forschungsprojekte:

- tbc

Zu den Lehrveranstaltungen der Abteilung Landschaftsökologie im UnivIS

Jobs

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